《最高院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第十五条规定：“原告以借据、收据、欠条等债权凭证为依据提起民间借贷诉讼，被告依据基础法律关系提出抗辩或者反诉，并提供证据证明债权纠纷非民间借贷行为引起的，人民法院应当依据查明的案件事实，按照基础法律关系审理。当事人通过调解、和解或者清算达成的债权债务协议，不适用前款规定”。
两被告未向原告支付工程款及退还工程保证金，经双方协商，两被告向原告出具了借条。尽管本案当事人之间系建设施工合同关系（基础法律关系），但因所涉借条系双方经结算后就两被告未支付工程保证金而出具，符合“当事人清算达成的债权债务协议”的要求，且所欠的工程款保证金也是双方确认的合法债务，符合合法的民事关系产生的债权债务的要件，双方应认定为转化型借贷关系。故原被告双方工程保证金按照借款处理，并不违反法律法规的强制性规定，双方当事人通过这种方式约定所欠款项合法有效，这种约定对原被告双方均具有约束力。